研究業績

Achievements

原著論文

Original Papers

  1. Furuike Y, Onoue Y, Saito S, Mori T*, Akiyama S*
    The priming phosphorylation of KaiC is activated by the release of its autokinase autoinhibition
    BioRxiv; doi: 10.1101/2024.03.21.584037 (2024)

  2. Furuike Y, Yamashita E, Akiyama S*
    Structure-function relationship of KaiC around dawn
    Biophysics and Physicobiology; doi: 10.2142/biophysico.bppb-v21.0001 (2023)

  3. Mukaiyama A*, Furuike Y, Yamashita E, Akiyama S
    Highly sensitive tryptophan fluorescence probe for detecting rhythmic conformational changes of KaiC in the cyanobacterial circadian clock system
    Biochemical Journal 479, 1505-1515; doi: 10.1042/BCJ20210544 (2022).

  4. Furuike Y, Mukaiyama A, Koda S, Simon D, Ouyang D, Ito-Miwa K, Saito S, Yamashita E, Nishiwaki-Ohkawa T, Terauchi K, Kondo T, Akiyama S*
    Regulation Mechanisms of the Dual ATPase in KaiC
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119, e2119627119; doi: 10.1073/pnas.2119627119 (2022)

  5. Furuike Y*, Mukaiyama A, Ouyang D, Ito-Miwa K, Simon D, Yamashita E, Kondo T, Akiyama S*
    Elucidation of Master Allostery Essential for Circadian Clock Oscillation in Cyanobacteria
    Science Advances 8, eabm8990; doi: 10.1126/sciadv.abm8990 (2022)

  6. Furuike Y, Ouyang D, Tominaga T, Matsuo T, Mukaiyama A, Kawakita Y, Fujiwara S*, Akiyama S*
    Cross-scale Analysis of Temperature Compensation in the Cyanobacterial Circadian Clock System
    Communications Physics 5, 75; doi: 10.1038/s42005-022-00852-z (2022)

    Press Release from IMS, QST, JAEA, J-PARC, CROSS:
    どうして生物の24時間リズムは安定なのか? ―水素原子の運動から迫る時計タンパク質の温度補償制御―

    Highlighted in:
    マイナビニュース
    Entamepost
    NEWS Collect

    Newspaper Articles (新聞報道):
    生物の24時間リズム一定に保たれる理由 分子研、QSTなど解明
    科学新聞, 10面, 2022年5月20日, 掲載

  7. Simon D, Mukaiyama A, Furuike Y, Akiyama S*
    Slow and Temperature-compensated Autonomous Disassembly of KaiB–KaiC Complex
    Biophysics and Physicobiology 19, e190008; doi: 10.2142/biophysico.bppb-v19.0008 (2022)

  8. Maruyama M, Furukawa Y, Kinoshita M, Mukaiyama A, Akiyama S, Yoshimura T*
    Adenylate kinase 1 overexpression increases locomotor activity in medaka fish
    PLoS ONE 17, e0257967; doi: 10.1371/journal.pone.0257967 (2022)

  9. Okumura M*, Kanemura S, Matsusaki M, Lee YH, Akiyama S, Inaba K*
    A unique leucine-valine adhesive motif supports structure and function of protein disulfide isomerase P5 via dimerization
    Structure 29, 1-14; doi.org/10.1016/j.str.2021.03.016 (2021)

  10. Ito-Miwa K*, Furuike Y, Akiyama S, Kondo T*
    Tuning the circadian period of cyanobacteria up to 6.6 days by the single amino acid substitutions in KaiC
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117, 20926-20931; doi.org/10.1073/pnas.2005496117 (2020)

  11. Anzai I, Tokuda E, Handa S, Misawa H, Akiyama S, Furukawa Y*
    Oxidative misfolding of Cu/Zn-superoxide dismutase triggered by non-canonical intramolecular disulfide formation
    Free Radical Biology and Medicine 147, 187-199; doi.org/10.1016/j.freeradbiomed.2019.12.017 (2020)

  12. Ouyang D, Furuike Y, Mukaiyama A, Ito-Miwa K, Kondo T, Akiyama S*
    Development and Optimization of Expression, Purification, and ATPase Assay of KaiC for Medium-Throughput Screening of Circadian Clock Mutants in Cyanobacteria
    International Journal of Molecular Science 20, 2789-2800; doi: 10.3390/ijms20112789 (2019)

  13. Okumura M*, Noi K, Kanemura S, Kinoshita M, Saio T, Inoue Y, Hikima T, Akiyama S, Ogura T*, Inaba K*
    Dynamic assembly of protein disulfide isomerase in catalysis of oxidative folding
    Nature Chemical Biology 15, 499–509; doi: 10.1038/s41589-019-0268-8 (2019)

  14. Mukaiyama A, Ouyang D, Furuike Y, Akiyama S*
    KaiC from a cyanobacterium Gloeocapsa sp. PCC 7428 retains functional and structural properties required as the core of circadian clock system
    International Journal of Biological Macromolecules 131, 67-73; doi: 10.1016/j.ijbiomac.2019.03.051 (2019)

  15. Furukawa Y*, Lim C, Tosha T, Yoshida K, Hagai T, Akiyama S, Watanabe S, Nakagome K, Shiro Y
    Identification of a novel zinc-binding protein, C1orf123, as an interactor with a heavy metal-associated domain
    PLoS One 13, e0204355; doi: 10.1371/journal.pone.0204355 (2018)

  16. Mukaiyama A*, Furuike Y, Abe J, Shin-ichi Koda, Yamashita E, Kondo T, Akiyama S*
    Conformational rearrangements of the C1 ring in KaiC measure the timing of assembly with KaiB
    Scientific Reports 8, 8803; doi:10.1038/s41598-018-27131-8 (2018)

  17. Nuemket N, Yasui N, Kusakabe Y, Nomura Y, Atsumi N, Akiyama S, Nango E, Kato Y, Kaneko M K, Takagi J, Hosotani M, Yamashita A*
    Structural basis for perception of diverse chemical substances by T1r taste receptors
    Nature Communications 8, 15530 (2017)

  18. Anzai I, Tokuda E, Mukaiyama A, Akiyama S, Endo F, Yamanaka K, Misawa H, Furukawa Y*
    A misfolded dimer of Cu/Zn-superoxide dismutase leading to pathological oligomerization in amyotrophic lateral sclerosis
    Protein Science 26, 484-496 (2017)

  19. Kanemura S, Okumura M, Yutani K, Ramming T, Hikima T, Appenzeller-Herzog C, Akiyama S, Inaba K*
    Human ER oxidoreductin-1α (Ero1α) undergoes dual regulation through complementary redox interactions with Protein Disulfide Isomerase (PDI)
    Journal of Biological Chemistry 291, 23952-23964 (2016)

  20. Furuike Y, Abe J, Mukaiyama A, Akiyama S*
    Accelerating in vitro studies on circadian clock systems using an automated sampling device
    Biophysics and Physicobiology 13, 235-241; doi: 10.2142/biophysico.13.0_235 (2016)

  21. Anzai I, Toichi K, Tokuda E, Mukaiyama A, Akiyama S, Furukawa Y*
    Screening of Drugs Inhibiting In vitro Oligomerizationof Cu/Zn-Superoxide Dismutase with a Mutation Causing Amyotrophic Lateral Sclerosis
    Frontiers in Molecular Biosciences 3, 40; doi: 10.3389/fmolb.2016.00040 (2016)

  22. Nango E, Akiyama S, Maki-Yonekura S, Ashikawa Y, Kusakabe Y, Krayukhina E, Maruno T, Uchiyama S, Nuemket N, Yonekura K, Shimizu M, Atsumi N, Yasui N, Hikima T, Yamamoto M, Kobayashi Y, Yamashita A*
    Taste Substance Binding Elicits Conformational Change of Taste Receptor T1r Heterodimer Extracellular Domains
    Scientific Reports 6, 25745; doi: 10.1038/srep25745 (2016)

  23. Furukawa Y*, Suzuki Y, Fukuoka M, Nagasawa K, Nakagome K, Shimizu H, Mukaiyama A, Akiyama S
    A molecular mechanism realizing sequence-specific recognition of nucleic acids by TDP-43
    Scientific Reports 6, 20576; doi: 10.1038/srep20576 (2016)

  24. Furukawa Y*, Anzai I, Akiyama S, Imai M, Cruz FJC, Saio T, Nagasawa K, Nomura T, and Ishimori K
    Conformational Disorder of the Most Immature Cu,Zn-Superoxide Dismutase Leading to Amyotrophic Lateral Sclerosis
    Journal of Biological Chemistry 291, 4144-4155 (2016)

  25. Abe J, Hiyama T B, Mukaiyama A, Son S, Mori T, Saito S, Osako M, Wolanin J, Yamashita E, Kondo T, and Akiyama S*
    Atomic-scale Origins of Slowness in the Cyanobacterial Circadian Clock
    Science 349, 312-316 (2015)

    Press Release from IMS, Nagyoa Univ. and Osaka Univ.:
    Earth’s Daily Rotation Period Encoded in an Atomic-level Protein Structure
    地球の自転周期、タンパク質が原子スケールで記憶

    Highlighted in ChemistryWorld (Royal Society of Chemistry)
    Molecular machinery behind circadian clock's ticking revealed
    ChemistryWorld, June 26 (2015)

    Comments on the paper from experts (国内専門家コメント):
    時計タンパク質が刻む生体の24時間周期、さらに一歩解明へ
    サイエンス・メディア・センター, オンライン, 平成27年7月4日掲載

    Highlighted in Chemistry Today (現代化学 FLASH):
    地球のリズムを刻むタンパク質の構造
    現代化学 534, 10-11 (2015)

    Newspaper Articles (新聞報道):
    生物時計:仕組みは…たんぱく質の化学反応の時間がもとに
    毎日新聞, 23面 オンライン, 平成27年7月6日掲載

    Newspaper Articles (新聞報道):
    時計タンパク質が原子レベルで記憶
    科学新聞, 6面, 平成27年7月10日掲載

    Newspaper Articles (新聞報道):
    「体内時計」、地球の自転周期と同調 ラン藻で実験
    日本経済新聞, オンライン,平成27年6月27日,掲載

  26. Mukaiyama A, Osako M, Hikima T, Kondo T, and Akiyama S*
    A protocol for preparing nucleotide-free KaiC monomer
    BIOPHYSICS 11, 79-84 (2015)

  27. Kojima R, Okumura M, Masui S, Kanemura S, Inoue M, Saiki M, Yamaguchi H, Hikima T, Suzuki M, Akiyama S and Inaba K*
    Radically Different Thioredoxin Domain Arrangement of ERp46, an Efficient Disulfide Bond Introducer of the Mammalian PDI Family
    Structure 22, 431-443 (2014)

  28. Akiyama S*, Hikima T
    Octuple Cuvette for Small-angle X-ray Solution Scattering
    Journal of Applied Crystallography 44, 1294-1296 (2011)

  29. Murayama Y, Mukaiyama A, Imai K, Onoue Y, Tsunoda A, Nohara A, Ishida T, Maéda Y, Terauchi K, Kondo T, and Akiyama S*
    Tracking and visualizing the circadian ticking of the cyanobacterial clock protein KaiC in solution
    The EMBO Journal 30, 68-78 (2011)

    Press Release from JST, Nagyoa Univ. and RIKEN:
    藍藻の「時計たんぱく質」のリズミカルな構造変化を解明 -分子時計の鼓動が聴こえる-

    Facility Information: SPring-8
    Rhythmic Structural Changes in Cyanobacterial Clock Protein
    Journal of Synchrotron Radiation May (2011)

    Newspaper Articles (新聞報道):
    時を刻むタンパク質
    中日新聞, 3面, 平成22年11月27日掲載

    Newspaper Articles (新聞報道):
    24時間周期で拍動
    日刊工業新聞, 16面, 平成22年11月29日掲載

  30. Akiyama S*
    Quality control of protein standards for molecular mass determinations by small-angle X-ray scattering
    Journal of Applied Crystallography 43, 237–243 (2010)

  31. Akiyama S*, Nohara A, Ito K, Maéda Y
    Assembly and Disassembly Dynamics of the Cyanobacterial Periodosome
    Molecular Cell 29, 703–716 (2008)

    Press Release from JST, RIKEN and Nagyoa Univ.:
    藍藻の「時計たんぱく質」が時を刻む機構を解明(時計を作る3つの歯車は時々刻々と組み合わせを変えながら回転する)

    Press Release from Cell Press:
    New research provides dynamic visualization of simplest circadian clock

    Molecular Biology Select of Cell Press
    The Ebb and Flow of the Cyanobacterial Clock
    Cell 133, 197, 199 (2008)

    Newspaper Articles (新聞報道):
    生物時計仕組み解明へ 理研と名大 藍藻たんぱく質で
    日刊工業新聞, ?面, 平成20年3月14日掲載

    Newspaper Articles (新聞報道):
    ラン藻の体内時計 1日周期で離合集散
    日経産業新聞, ?面, 平成20年3月14日掲載

  32. Inaba K, Suzuki M, Maegawa K, Akiyama S, Ito K, Akiyama Y*
    A Pair of Circularly Permutated PDZ Domains Control RseP, the S2P Family Intramembrane Protease of Escherichia coli
    The Journal of Biological Chemistry 283, 35042–25052 (2008)

  33. Uzawa T, Nishimura C, Akiyama S, Ishimori K, Takahashi S*, Dyson H J, Wright P E*
    Hierarchical folding mechanism of apomyoglobin revealed by ultra-fast H/D exchange coupled with 2D NMR
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 37, 13859–13864 (2008)

  34. Yamada S#, Akiyama S#, Sugimoto H, Kumita H, Ito K, Fujisawa T, Nakamura H, Shiro Y*
    The signaling pathway in histidine kinase and the response regulator complex revealed by X-ray crystallography and solution scattering
    Journal of Molecular Biology 362, 123-139 (2006)

  35. Uzawa T, Kimura T, Ishimori K, Morishima I, Matsui T, Ikeda-Saito M, Takahashi S*, Akiyama S, Fujisawa T*
    Time-resolved small-angle X-ray scattering investigation of the folding dynamics of heme oxygenase: implication of the scaling relationship for the submillisecond intermediates of protein folding
    Journal of Molecular Biology 357, 997-1008 (2006)

  36. Kimura T, Uzawa T, Ishimori K, Morishima I, Takahashi S*, Konno T, Akiyama S, Fujisawa T*
    Specific collapse followed by slow hydrogen-bond formation of β-sheet in the folding of single-chain monellin
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 102, 2748-2753 (2005)

  37. Kimura T, Akiyama S, Uzawa T, Ishimori K, Morishima I, Fujisawa T, and Takahashi S*
    Specifically collapsed intermediate in the early stage of the folding of ribonuclease A
    Journal of Molecular Biology 350, 349-362 (2005)

  38. Akiyama S, Fujisawa T*, Ishimori K, Morishima I, and Aono S
    Activation Mechanisms of Transcriptional Regulator CooA Revealed by Small-Angle X-ray Scattering
    Journal of Molecular Biology 341, 651-668 (2004)

  39. Kuwamoto S, Akiyama S, and Fujisawa T*
    Radiation damage to a protein solution, detected by synchrotron X-ray small-angle scattering: dose-related considerations and suppression by cryoprotectants
    Journal of Synchrotron Radiation 11, 462-468 (2004)

  40. Uzawa T, Akiyama S, Kimura T, Takahashi S*, Ishimori K, Morishima I, and Fujisawa T*
    Collapse and Search Dynamics of Apomyoglobin Folding Revealed by Submillisecond Observations of α-helical content and compactness
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 101, 1171-1176 (2004)

    Commentary:
    Roder H.
    Stepwise Helix Formation and Chain Compaction during Protein Folding
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 101, 1793-1794 (2004)

    Press Release from RIKEN:
    タンパク質の折り畳み過程をリアルタイムで観測

  41. Akiyama S, Takahashi S*, Kimura T, Ishimori K, Morishima I, Nishikawa Y, and Fujisawa T*
    Conformational Landscape of Cytochrome c Folding Studied by Microsecond-Resolved Small-Angle X-Ray Scattering
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 99, 1329-1334 (2002)

    Commentary:
    Brooks C L, III
    Viewing Protein Folding from Many Perspectives
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 99, 1099-1100 (2002)

    Commentary:
    汲田 英之
    SPring-8放射光を用いたタンパク質の折れ畳み過程の観測
    化学と工業 57, 1308 (2004)

  42. Kimura T, Takahashi S*, Akiyama S, Uzawa T, Ishimori K, and Morishima I*
    Direct Observation of the MultiStep Helix Formation of Poly-L-Glutamic Acids
    Journal of American Chemical Society 124, 11596-11597 (2002)

  43. Akiyama S, Takahashi S, Ishimori K, and Morishima I*
    Stepwise formation of α-helices during cytochrome c folding
    Nature Structural & Molecular Biology (Nature Structural Biology) 7, 514-520 (2000)

    Commentary:
    Yeh S R and Rousseau D L
    Hierarchical Folding of Cytochrome c
    Nature Structural & Molecular Biology (Nature Structural Biology) 7, 443-445 (2000)

    Press Release from Nature Publishing Group:
    A powerful new tool for studying protein folding

    Newspaper Articles (新聞報道):
    遺伝子の作るアミノ酸→たんぱく質 0.01秒の過程解析
    讀賣新聞, 1面, 平成12年5月30日掲載

英文総説

Reviews in English

  1. Furuike Y*, Mukaiyama A, and Akiyama S*
    Master allostery in clock protein KaiC orchestrates circadian rhythm
    SPring-8/SACLA Research Frontiers 2022, 26-27.

  2. Akiyama S*, Kamikubo H
    Beyond multi-disciplinary and cross-scale analyses of the cyanobacterial circadian clock system
    Biophysics and Physicobiology, doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v18.031 (2021)

  3. Akiyama S*
    Reasons for Seeking Information on the Molecular Structure and Dynamics of Circadian Clock Components in Cyanobacteria
    Circadian Rhythms in Bacteria and Microbiomes, 138-145 (2021)

  4. Akiyama S*, Aoki K*, Kubo Y*
    Biophysical Research in Okazaki, Japan
    Biophysical Reviews; doi.org/10.1007/s12551-020-00633-4 (2020)

  5. Akiyama S*
    Treasurer’s comments on the financial position of the Biophysical Society of Japan
    Biophysical Reviews; doi.org/10.1007/s12551-020-00623-6 (2020)

  6. Mukaiyama A, Furuike Y, Akiyama S*
    A kinetic mechanism gating the assembly of KaiB-KaiC complex in the cyanobacterial circadian clock system
    Biological Rhythms, 29-34 (2019)

  7. Akiyama S*, Mukaiyama A, Abe J, Furuike Y
    Cyanobacterial circadian clock system: how and why can it be so slow and stable?
    Biological Clocks: with reference to suprachiasmatic nucleus, 73-77 (2017)

  8. Abe J, Mukaiyama A, Akiyama S*
    Absolute slowness encoded in the circadian clock protein KaiC
    SPring-8/SACLA Research Frontiers 2015, 24-25 (2016)

  9. Akiyama S*
    Structural and dynamic aspects of protein clocks: How can they be so slow and stable?
    Cellular and Molecular Life Sciences 69, 2147-2160 (2012).

  10. Mukaiyama A, Kondo T, Akiyama S*
    Visualization of circadian ticking of cyanobacterial clock protein KaiC in real time
    SPring-8 Research Frontiers 2011, 46-47 (2012)

  11. Akiyama S*, Nohara A, Ito K, and Maéda Y
    Real-Time Small-Angle X-Ray Scattering Observation of Assembly and Disassembly Dynamics of Cyanobacterial Periodosome
    SPring-8 Research Frontiers 2007, 24-25 (2008)

  12. Yamada S, Akiyama S, and Shiro Y*
    Signaling Pathway in Two-component Regulatory System Revealed by Combination of X-ray Crystallography and Solution Scattering Technique
    SPring-8 Research Frontiers 2006, 32-33 (2007)

  13. Takahashi S, Akiyama S, Ishimori K, and Morishima I*
    CD Measurements on the Early Folding Intermediate of Cytochrome c Using the Fast Flow Mixer
    Old and New Views of Protein Folding (Elsevier Science, Amsterdam), 75-84 (1999)

邦文総説

Reviews in Japanese

  1. 秋山 修志*,古池 美彦,向山 厚
    変化し続ける概日時計のかたち
    時間生物学 24, 92-99 (2018)

  2. 秋山 修志*
    芸は身を助く?
    生物物理 58, 181 (2018)

  3. 秋山 修志*
    概日時計因子の構造や動態を調べる意義とは?
    生物物理 56, 266-270 (2016)

  4. 秋山 修志*
    時間生物学と放射光科学の接点
    放射光 29, 56-63 (2016)

  5. 阿部 淳,向山 厚,秋山 修志*
    時計タンパク質KaiCの「遅さ」が刻み込まれた原子構造
    SPring-8/SACLA利用者情報 21, 2-4 (2016)

  6. 向山 厚,阿部 淳,孫 世永,秋山 修志*
    タンパク質の化学反応が細胞内の時を計る
    実験医学 33, 3119-3122 (2015)

  7. 秋山 修志*
    タンパク質時計―時間と空間の狭間を漂うように―
    生物物理 52, 102-103 (2012)

  8. 秋山 修志,近藤 孝男*
    KaiCタンパク質による概日時間
    細胞工学 30, 1269-1276 (2011)

  9. 秋山 修志*, 向山 厚
    時計タンパク質KaiCの概日性分子鼓動
    実験医学 29, 1281-1284 (2011)

  10. 秋山 修志*
    X線小角散乱でナノ空間を照らし出す
    現代化学 468, 54-58 (2010)

  11. 秋山 修志*
    躍動するシステムを時間分解X線散乱・回折法で観る
    日本結晶学会誌 51, 51-51 (2009)

  12. 秋山 修志*
    リアルタイムX線小角散乱でみた藍藻時計タンパク質の離合集散ダイナミクス
    生物物理 49, 135-136 (2009)

  13. 秋山 修志*
    リアルタイムX線小角散乱で観察した藍藻時計タンパク質の離合集散ダイナミクス
    放射光 21, 305-312 (2008)

  14. 秋山 修志*
    X線小角散乱でみたタンパク質の構造変化・離合集散
    生物物理 47, 133-138 (2007)

  15. 高橋 聡*, 鵜澤 尊規, 秋山 修志, 藤澤 哲朗
    サブミリ秒分割X 線小角散乱法の開発と蛋白質の折り畳み過程の研究
    放射光 17, 127-134 (2004)

  16. 高橋 聡*, 秋山 修志
    蛋白質の折りたたみ運動をとらえる
    蛋白質 核酸 酵素 46, 1545-1552 (2001)

著書

Books

  1. 秋山 修志*
    タンパク質によって操られている体内時計
    「放射光が解き明かす驚異のナノ世界」 , 講談社ブルーバックス, 79-81 (2011)

国際招待講演

Invited Talks

  1. Akiyama S*
    Molecular Aspects of Circadian Clock Evolution Inspired by the Example of Cyanobacteria
    SRBR 2022 Biennial Conference, Amelia Island, FL, USA (May 17, 2022)

  2. Akiyama S*
    Screening and Characterization of Temperature-dependent Circadian Clock Mutants in Cyanobacteria
    5th Asian Forum on Chronobiology, Kaifeng, China (July 16, 2021)

  3. Akiyama S*
    Keynote Lecture: Cyanobacterial circadian clock system through the chemistry of rhythm, structure, and evolutionary diversity
    ELSI 8th International Symposium, Tokyo, Japan (Feb 4, 2020)

  4. Akiyama S*
    Keynote Lecture: Frontiers of the Intermolecular Interactions Analysis of Biomolecules promoted by BioSAS
    PF Workshop, Tsukuba, Japan (Sep 12, 2019)

  5. Akiyama S*
    ATPase-based in vitro Screening for KaiC Clock Mutants in Cyanobacteria
    XVI Congress of the European Biological Rhythms Society, Lyon, France (Aug 27, 2019)

  6. Akiyama S*
    Keynote Lecture: Cyanobacterial circadian clock system through the chemistry of rhythm, structure, and evolutionary diversity
    V World Congress of Chronobiology, Suzhou, China. (April 25, 2019)

  7. Akiyama S*
    trans-Hierarchical Nature of Cyanobacterial Circadian Clock System
    SRBR 2018, Sapporo, Japan (Jul 14, 2018)

  8. Akiyama S*
    trans-Hierarchical Nature of Cyanobacterial Circadian Clock System
    Frontier Bioorganization Forum 2018, Okazaki, Japan (Jul 8, 2018)

  9. Akiyama S*
    Slow and Temperature-compensated ATP Hydrolysis Reaction Catalyzedby Circadian Clock Protein KaiC
    The 3rd Solar FuelMaterial Workshop, Osaka, Japan (Mar 13, 2018)

  10. Akiyama S*
    The frontier in cyanobacterial circadian clock system
    OIIB Summer School 2017, Okazaki, Japan (Aug 17, 2017)

  11. Akiyama S*
    Biological X-ray Solution Scattering Activities at the Institute for Molecular Science
    Okazaki Conference 2017 on Grand Challenges in Small-angle Scattering, Okazaki, Japan (Mar 19, 2017)

  12. Akiyama S*
    Atomic-scale origins of slowness and temperature compensation in KaiC
    Circadian Clock of Cyanobacteria during 1991-2017, Nagoya, Japan (Mar 12, 2017)

  13. Akiyama S*
    Cyanobacterial circadian clock system. How and why can it be so slow and stable?
    Sapporo Symposium on Biological Rhythm, Sapporo, Japan (Nov 10, 2016)

  14. Akiyama S*
    X-ray Solution Scattering as Research Tools for Bio-molecular Systems
    Winter School of ASIA CORE Program, Beijing, China (Feb 26, 2016)

  15. Mukaiyama A*, Abe J, and Akiyama S
    Circadian periodicity encoded in KaiC ATPase
    Winter School of ASIA CORE Program, Beijing, China (Feb 26, 2016)

  16. Akiyama S*
    Atomic-scale origins of slowness in the cyanobacterial circadian clock
    8th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science: Experiments and Simulation, Okazaki, Japan (Feb 16, 2016)

  17. Akiyama S*
    KaiC as Circadian Pacemaker of Cyanobacterial Circadian Clock
    European Biological Rhythms Society (EBRS)/World Congress of Chronobiology (WCC) meeting, Manchester, UK (Aug 6, 2015)

  18. Akiyama S*
    KaiC as Circadian Pacemaker of Cyanobacterial Circadian Clock
    Society for Research on Biological Rhythms, Montana, USA (Jun 17, 2014)

  19. Akiyama S*
    Small-angle x-ray Scattering Study on Cyanobacterial Clock Protein KaiC
    The 6th Taiwan-Japan Joint Meeting on X-ray and Neutron Scattering, Taipei, Taiwan (Mar 11, 2014)

  20. Akiyama S*
    KaiC as A Circadian Pacemaker of Cyanobacterial Circadian Clock
    Asian CORE Winter School on Frontiers of Molecular, Photo-, and Material Sciences, Taipei, Taiwan (Feb 25, 2014)

  21. Akiyama S*
    KaiC as A Circadian Pacemaker of Cyanobacterial Circadian Clock
    6th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science, Okazaki, Japan (Nov 27, 2013)

  22. Akiyama S*
    KaiC as a Circadian Pacemaker of Cyanobacterial Circadian Clock
    15th Japan-Korea Symposium on Molecular Science, "Hierarchical Structure from Quantum to Functions of Biological Systems", Sannomiya, Japan (Jul 5, 2013)

  23. Akiyama S*
    Circadian Pacemaker of Cyanobacteria by Intra-molecular Feedback Regulation of KaiC ATPase
    IMS Workshop on "Hierarchical Molecular Dynamics: From Ultrafast Spectroscopy to Single Molecule Measurements", Okazaki, Japan (Jun 25, 2013)

  24. Akiyama S*
    Tracking and Visualizing Intramolecular Feedback in Cyanobacterial Clock Protein KaiC
    The 5th Japan-Taiwan joint meeting on neutron and X-ray scattering, Tokai, Japan (Feb 26, 2013)

  25. Akiyama S*
    Tracking and Visualizing Intramolecular Feedback in Cyanobacterial Clock Protein KaiC
    The 12th KIAS Conference on Protein Structure and Function, Seoul, Korea (Oct 11, 2012)

  26. Akiyama S*
    Quality Control of Protein Standards for Molecular Mass Determinations by SAXS
    XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2011), Madrid, Spain (Aug 23, 2011)

  27. Akiyama S*
    Assembly and Disassembly Dynamics of Cyanobacterial Clock Proteins Studied by Real-time Small-angle X-ray Scattering
    Gordon Research Conferences (X-ray Science), Waterville, ME, USA (Aug 5, 2009)

  28. Akiyama S*
    Real-time SAXS Observation of Assembly and Disassembly Dynamics of Cyanobacterial Clock Proteins
    NSRRC Workshop X-ray Crystallography / Spectroscopy, Hsinchu, Taiwan (Oct 9, 2008)

  29. Akiyama S*
    SAXS for Biomolecular Solutions
    The 1st interest group meeting on biomolecular solution X-ray scattering Part 2, Hsinchu, Taiwan (Oct 8, 2008)

  30. Akiyama S*
    Protein Folding Revealed by Submillisecond Observations of α-helical Content and Compactness
    The 1st interest group meeting on biomolecular solution X-ray scattering Part 1, Hsinchu, Taiwan (Oct 7, 2008)

  31. Akiyama S*
    Real-time Small-Angle X-ray Scattering Study of Assembly and Disassembly Cycles of Cyanobacterial Circadian Clock Proteins
    ACA 2008 Annual Meeting, Knoxville, TN, USA (Jun 2, 2008)

  32. Akiyama S*
    Assembly and Disassembly Dynamics of Cyanobacterial Clock Proteins
    SSF/JST-PRESTO Joint Symposium, Stockholm, Sweden (May 26, 2008)

  33. Akiyama S*
    Real-time SAXS Observation of Assembling-Disassembling Complexes of Cyanobacterial Circadian Clock Proteins
    9th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation, Manchester, UK (Aug. 13, 2007)

  34. Akiyama S*
    Signal Transduction Pathway in Histidine Kinase and Response Regulator Complex Revealed by Joint Usage of Crystallography and Small-Angle X-ray Scattering
    XIII International Conference on Small-angle Scattering, Kyoto, Japan (Jul. 11, 2006)

  35. Akiyama S*
    Sub-Millisecond Folding Dynamics & Low-Resolution Modeling of Proteins at BL45-SAXS Station
    RIKEN-CCLRC Daresbury Symposium: Structural Biology, Daresbury, UK (May 14, 2004)

国内招待講演

Invited Talks

  1. 秋山 修志*
    概日時計のこれまでとこれから
    生物科学異分野融合シンポジウム2023、うみんちゅワーフ(Mar 3, 2024)

  2. 秋山 修志*
    Autonomous Disassembly of Circadian Clock System at Dawn
    学術変革領域研究B「時間タンパク質学」領域会議2023、熱海金城館(Dec 8, 2023)

  3. 秋山 修志*
    概日時計のこれまでとこれから
    2023年生物リズム若手研究者の集い、御殿場高原時之栖(Nov 26, 2023)

  4. 秋山 修志*
    概日時計のこれまでとこれから
    大学共同利用機関2023 現代の社会問題に挑む,日本科学未来館(Oct 22, 2023)

  5. 秋山 修志*
    単純化指向型アプローチによるシアノバクテリア概日時計システムの源振動解明
    長瀬科学技術振興財団研究成果発表会,大阪科学技術センター(Apr 28, 2023)

  6. 秋山 修志*
    概日時計システムに夜明けを告げる時計タンパク質の自律的な複合体解離
    日本化学会第103春季年会 次世代分子システム化学のフロンティア-協奏的機能発現のメカニズム, 東京理科大学(Mar 23, 2023)

  7. 秋山 修志*
    どうして生物の24時間リズムは安定なのか?
    2022年度量子ビームサイエンスフェスタセミナー, つくば国際会議場(Mar 15, 2023)

  8. 秋山 修志*
    Autonomous Disassembly of Circadian Clock System at Dawn
    第60回日本生物物理学会年会, 函館アリーナ(Oct 29, 2022)

  9. 秋山 修志*
    Molecular Aspects of Circadian Clock Evolution
    セミナー, 名古屋工業大学(Sep 12, 2022)

  10. 秋山 修志*
    Cyanobacterial circadian clock system through the chemistry of rhythm, structure, and evolutionary diversity
    バイオ単分子研究会、オンライン(Mar 30, 2021)

  11. 秋山 修志*
    生命のリズムを化学する
    GTRリトリート2020、オンライン(Sep 30, 2020)

  12. 秋山 修志*
    Biochemistry and Structure of Circadian Clock Protein, KaiC
    第92回日本生化学会大会,パシフィコ横浜 (Sep 20, 2019)

  13. 秋山 修志*
    地球の自転周期がエンコードされたタンパク質、KaiC
    第13回分子科学討論会,名古屋大学 (Sep 19, 2019)

  14. Akiyama S*
    Slowness and temperature compensation both transferred from intra- to inter-molecular scales in cyanobacterial circadian clock
    The 91st Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society, Kyoto, Japan (Sep 24, 2018)

  15. 秋山 修志*
    なぜ?どうして?いまだ説明できない生物時計の残された謎
    第58回生物物理若手の会 夏の学校,ホテルパーク (Aug 29, 2018)

  16. 秋山 修志*
    藍藻における概日周期と温度補償性の分子科学
    蛋白研セミナー / SPring-8 先端利用技術ワークショップ,大阪大学 (Aug 9, 2018)

  17. 秋山 修志*
    分⼦科学研究所・協奏分⼦システム研究センターにおける概⽇時計研究と⽀援体制の構築
    CyanoClock 1.0,名古屋大学 (Jun 29, 2018)

  18. 秋山 修志*
    地球の自転周期がエンコードされたタンパク質、KaiC
    講演会,京都大学 (Feb 6, 2018)

  19. Akiyama S*
    Cyanobacterial circadian clock system: How and why can it be so slow and stable?
    Sokendai Asian Winter School,分子科学研究所 (Dec 15, 2017)

  20. Akiyama S*
    Frequency characteristics as a basis for meta-tuning of the Cyanobacterial Circadian Clock
    ConBio2017,神戸ポートアイランド (Dec 9, 2017)

  21. 秋山 修志*
    Frequency Characteristics and Temperature Compensation in the Cyanobacterial Circadian Clock
    第24回日本時間生物学会学術大会,京都大学 (Oct 29, 2017)

  22. 秋山 修志*
    Lessons from Cyanobacterial Circadian Clock System
    第55回日本生物物理学会年会,熊本大学 (Sep 20, 2017)

  23. 秋山 修志*
    生命の時間
    第4回 大型実験施設とスーパーコンピュータとの連携利用シンポジウム,東京・秋葉原UDX (Sep 8, 2017)

  24. 秋山 修志*
    藍藻生物時計システムにおける概日周期の根源と貫階層性
    第69回日本細胞生物学会大会,仙台国際センター (Jun 13, 2017)

  25. 秋山 修志*
    生物の不思議 ~ 体内時計 ~
    日本放射光学会市民公開講座,神戸芸術センター (Jan 8, 2017)

  26. 秋山 修志*
    生体分子システム研究に必要なツールとは?
    中性子生命科学研究会 「生命科学における中性子利用の現状と未来」,IQBRC1階大会議室 (May 17, 2016)

  27. 秋山 修志*
    藍藻生物時計システムにおける分子動態と貫階層性
    次ステージ機能生命科学の展望,岡崎コンファレンスセンター (Mar 10, 2016)

  28. 秋山 修志*
    タンパク質の奏でる生体リズム
    城北科学の日,岡崎市立城北中学校 (Feb 12, 2016)

  29. 秋山 修志*
    階層横断的に機能する分子システムの構造アンサンブルとダイナミクス研究
    第29回日本放射光学会年会,東京大学柏の葉キャンパス駅前サテライト (Jan 11, 2016)

  30. 秋山 修志*
    藍藻生物時計システムに見られる貫階層性
    第6回神経科学と構造生物学の融合研究会,岡崎コンファレンスセンター (Nov 26, 2015)

  31. 秋山 修志*
    藍藻の時計タンパク質に内包された概日周期と遅さの根源
    藍藻の分子生物学2015, かずさアカデミアホール (Nov 17, 2015)

  32. Akiyama S*
    KaiC as Circadian Pacemaker of Cyanobacterial Circadian Clock
    Grand Design of Molecular Systems, 分子科学研究所 (Oct 8, 2015)

  33. 秋山 修志*
    生物時計システムに見られる階層性 ~ 原子から細胞スケールまでを貫くロジック ~
    2015年度第1回バイオ単分子研究会, 新世代研究所 (Aug 26, 2015)

  34. 秋山 修志*
    生物時計システムに見られる階層性 ~ 原子から細胞スケールまでを貫くロジック ~
    第3回Neutrons in Biology研究会, 日本原子力研究開発機構 (Mar 3, 2015)

  35. 秋山 修志*
    ガイドラインに関する査読者とのやり取り
    分子システム研究における溶液散乱, 分子科学研究所 (Dec 20, 2014)

  36. 秋山 修志*
    生物の時間をはかるタンパク質時計
    国研セミナー,分子科学研究所 (Nov 28, 2014)

  37. Akiyama S*
    Watching slow but ordered dynamics of clock proteins
    第21回日本時間生物学会学術大会,九州大学 (Nov 8, 2014)

  38. 秋山 修志*
    概日時計システム研究におけるbioSANSへの期待と展望
    平成26年度第1回生物構造学研究会, エッサム神田ホール (Oct 3, 2014)

  39. 秋山 修志*
    タンパク質時計のブラックボックスを開く
    第4回神経科学と構造生物学の融合研究会,岡崎コンファレンスセンター (Nov 19, 2013)

  40. Akiyama S*
    The frontier in protein–clock system ~ How do organisms measure time? ~
    サマースクール 2013「生命システムの動秩序」,岡崎統合バイオサイエンスセンター (Aug 24, 2013)

  41. 秋山 修志*
    タンパク質の奏でる生体リズム ~ 生物はどのようにして時間をはかるのか? ~
    市民公開講座 第95回分子科学フォーラム, 岡崎コンファレンスセンター (Oct 20, 2012)

  42. 秋山 修志*
    時計タンパク質のダイナミクス
    第19回時間生物学会学術大会, 北海道大学 (Sep 14, 2012)

  43. 秋山 修志*
    時計タンパク質のダイナミクス
    放射光将来光源利用サイエンス若手シンポジウム, 東京大学 (Aug 18, 2012)

  44. 秋山 修志*
    時計タンパク質KaiCの概日性分子鼓動
    第12蛋白質科学会年会, 名古屋国際会議場 (Jun 22, 2012)

  45. 秋山 修志*
    時計タンパク質のダイナミクス
    放射光将来光源利用サイエンス若手シンポジウム, 東京大学 (Aug 18, 2012)

  46. 秋山 修志*
    生物の時間をはかるタンパク質時計 ~ 分子の概日運動をとらえるための工夫 ~
    第7回機構技術研究会, 岡崎コンファレンスセンター (May 23, 2012)

  47. 秋山 修志*
    タンパク質時計に秘められた秩序ある遅いダイナミクス ~ 源振の分子科学的解明と新光源への期待 ~
    第25回日本放射光学会年会, 鳥栖市民文化会館 (Jan 7, 2012)

  48. Akiyama S*
    Circadian Pacemaker of Cyanobacteria by Intra-molecular Feedback of KaiC ATPase
    GCOE/International Symposium "Designing the Circadian Clock", Nagoya University (Nov 26, 2011)

  49. 秋山 修志*
    X線小角散乱を用いた動的解析
    第1回名古屋大学反応科学超高圧電子顕微鏡ワークショップ, 名古屋大学 (Nov 21, 2011)

  50. 秋山 修志*
    Kaiタンパク質時計に秘められた秩序ある遅いダイナミクス
    分子研研究会「実験と理論による高次分子システムの機能発現の分子論的理解」, 分子科学研究所 (Nov 2, 2011)

  51. 秋山 修志*
    Kaiタンパク質時計に秘められた秩序ある遅いダイナミクス
    分子研研究会「実験と理論による高次分子システムの機能発現の分子論的理解」, 分子科学研究所 (Nov 2, 2011)

  52. 秋山 修志*
    シアノバクテリア時計タンパク質 KaiC の分子鼓動の可視化
    第84回日本生化学会大会, 国立京都国際会館 (Nov 22, 2011)

  53. 秋山 修志*
    シアノバクテリア時計タンパク質はどのようにして時を測るのか
    分子研セミナー, 分子科学研究所 (Apr 4, 2011)

  54. 秋山 修志*
    タンパク質溶液の小角X線散乱データ解析
    第1回高分子科学研究会, SPring-8 (Nov 6, 2010)

  55. 秋山 修志*
    生物の不思議 ~ 体内時計 ~
    高校生のための「サマーサイエンスキャンプ2010, SPring-8 (Aug 10, 2010)

  56. 秋山 修志*
    シアノバクテリア時計タンパク質はどのようにして時を測るのか
    第1回バイオ単分子研究会, 新世代研究所 (Aug 6, 2010)

  57. 秋山 修志*
    時計タンパク質の複合体形成ダイナミクスと遅い構造転移
    第10回日本蛋白質科学会年会, 札幌コンベンションセンター (Jun 16, 2010)

  58. 秋山 修志*
    生物時計のからくりを放射光で解き明かす
    第13回SPring-8シンポジウム, 東京ステーションコンファレンス (Sep 4, 2009)

  59. 秋山 修志*
    X線小角散乱に流行の兆し ~ 基礎的な注意点とこれからの展望 ~
    第21回生物無機化学夏季セミナー, 聖護院御殿荘 (Aug 2, 2008)

  60. 秋山 修志*
    時分割X線小角散乱によるシアノバクテリア時計タンパク質の離合集散ダイナミクス計測
    ERLサイエンス研究会1, 高エネルギー加速器研究機構 (Mar 17, 2008)

  61. 秋山 修志*
    X線小角散乱による構造変化の研究
    大阪大学蛋白質研究所セミナー「蛋白質の構造変化の仕組みを探る」, 大阪大学蛋白質研究所 (Mar 3, 2008)

  62. 秋山 修志*
    X線小角散乱による構造変化の研究
    大阪大学蛋白質研究所セミナー「蛋白質の構造変化の仕組みを探る」, 大阪大学蛋白質研究所 (Mar 3, 2008)

  63. 秋山 修志*
    リアルタイムX線小角散乱でみたシアノバクテリア時計蛋白質の離合集散ダイナミクス
    日本生物物理学会第45回年会若手奨励賞講演, パシフィコ横浜 (Dec 21, 2007)

  64. 秋山 修志*
    X線小角散乱で調べた蛋白質のシグナル伝達機構と分子形状変化の相関
    日本顕微鏡学会 生体構造解析分科会, 大阪大学中之島センター (Dec 21, 2006)

  65. 秋山 修志*
    蛋白質の研究にX線小角散乱が貢献できること
    分子研研究会「生体における金属イオンの役割とその利用」, 岡崎コンファレンスセンター (Mar 19, 2006)

Correspondent Shuji Akiyama @CIMoS,IMS,NINS