分子科学研究所 協奏分子システム研究センター tag:groups.ims.ac.jp,2019-06-09:/organization/cimos//5 2023-07-08T00:46:13Z 大学共同利用機関法人　自然科学研究機構　分子科学研究所　協奏分子システム研究センター(CIMoS)　公式ホームページです。研究内容、記事報道、論文・発表等掲載しています。 Design of allosteric sites into rotary motor V1-ATPase by restoring lost function of pseudo-active sites - 研究 tag:cimos.xsrv.jp,2023:/organization/cimos/re//9.834 2023-07-07T00:28:02Z 2023-07-08T00:46:13Z Nature Chemistry , doi.org/10.1038/s4155... webmaster Nature Chemistry , doi.org/10.1038/s41557-023-01256-4 (2023)

]]> 【プレスリリース】❝進化の過程で失った機能を復活させ、回転型分子モーターの加速に成功
　～タンパク質複合体の協奏的機能を制御する新手法～❞（古賀グループ　小杉助教ら）

]]> 古賀グループの研究成果がNature Chemistryに掲載されました - ニュース・刊行物 tag:cimos.xsrv.jp,2023:/organization/cimos/in//10.832 2023-07-07T00:03:18Z 2023-07-08T00:05:52Z 　❝進化の過程で失った機能を復活させ、回転型分子モーターの加速に成功 　～タンパ... webmaster 　❝進化の過程で失った機能を復活させ、回転型分子モーターの加速に成功

　～タンパク質複合体の協奏的機能を制御する新手法～❞（古賀グループ　小杉助教ら）

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]]> 第28回CIMoSセミナーChirality related properties of helicene and tetrathiafulvalene materials - セミナー・シンポジウム tag:cimos.xsrv.jp,2023:/organization/cimos/se//12.830 2023-03-10T11:22:18Z 2023-03-07T07:01:50Z Chirality manifests itself in many areas... webmaster Chirality manifests itself in many areas of physics, chemistry and biology, where objects or materials can exist in two non super-imposable forms, one being the mirror image of the other.[1] Introduction of chirality into conducting systems is a topic of much current interest as it allows the preparation of multifunctional materials in which the chirality might modulate the structural disorder or expresses its influence through the electrical magneto-chiral anisotropy effect.[2] The access to various chiral electroactive precursors for molecular conductors is therefore of paramount importance.[3] Our endeavour towards chiral molecular superconductors will be outlined.[4]

Another chirality related effect is the chirality induced spin selectivity (CISS) consisting in a preferential spin transmission through a chiral material. We will discuss helicene and tetrathiafulvalene based materials showing this property.[5]

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[1] G. H. Wagnière, On Chirality and the Universal Asymmetry 2007, Wiley-VCH, Weinheim.

[2] F. Pop, P. Auban-Senzier, E., Canadell, G. L. J. A. Rikken, N. Avarvari, Nat. Commun. 2014, 5, 3757.

[3] a) N. Avarvari, J. D. Wallis, J. Mater. Chem. 2009, 19, 4061; b) F. Pop, N. Zigon, N. Avarvari, Chem. Rev. 2019, 119, 8435.

[4] N. Mroweh, C. Mézière, F. Pop, P. Auban-Senzier, P. Alemany, E. Canadell, N. Avarvari, Adv. Mater. 2020, 32, 2002811.

[5] Y. Liang, K. Banjac, K. Martin, N. Zigon, S. Lee, N. Vanthuyne, F. A. Garcés-Pineda, J. R. Galán-Mascarós, X. Hu, N. Avarvari, M. Lingenfelder, Nat. Commun. 2022, 13, 3356.

日時 2023年3月10日（水）　16：00〜17：00
場所 分子科学研究棟　研究棟201号室
題目 Chirality related properties of helicene and tetrathiafulvalene materials
講演者 Prof. Narcis Avarvari
（Laboratoire MOLTECH-Anjou, CNRS - Universite d'Angers, France）
]]> Giant spin polarization and a pair of antiparallel spins in a chiral superconductor - 研究 tag:cimos.xsrv.jp,2023:/organization/cimos/re//9.828 2023-01-19T10:01:01Z 2023-02-02T10:07:29Z Nature 613, 479-484 ; doi:10.1038/s4158... webmaster Nature 613, 479-484 ; doi:10.1038/s41586-022-05589-x (2023)

]]> 【プレスリリース】磁石で右と左を区別することに成功 ～鏡と電子スピンの不思議な関係～（山本浩史グループら）

]]> 山本グループの研究成果がNatureに掲載されました - ニュース・刊行物 tag:cimos.xsrv.jp,2023:/organization/cimos/in//10.827 2023-01-19T09:54:49Z 2023-02-02T10:08:06Z 磁石で右と左を区別することに成功 ～鏡と電子スピンの不思議な関係～（山本浩史グル... webmaster 磁石で右と左を区別することに成功 ～鏡と電子スピンの不思議な関係～（山本浩史グループら）

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]]> 第27回CIMoSセミナーFRET imaging by detecting sensitized acceptor anisotropy with dim fluorescent donor - セミナー・シンポジウム tag:cimos.xsrv.jp,2023:/organization/cimos/se//12.825 2023-01-11T12:44:46Z 2023-01-10T02:11:52Z Over the last two decades Förster resona... webmaster Over the last two decades Förster resonance energy transfer (FRET) became a common platform to design protein-based biosensors. The basic idea of FRET-based biosensors is detecting conformational change of "sensing" domains by fusing two fluorescent proteins, FRET donor and acceptor. FRET efficiency has been used commonly to read out the conformational change, which predominantly depends on the proximity between the donor and acceptor. Contrary, although relative orientation of dipole moments is in theory another factor determining the FRET efficiency, detecting the change in angle between donor and acceptor is still challenging. Here I will introduce a new mode of FRET quantification highlighting the angular displacement by monitoring sensitized acceptor anisotropy. Making dim fluorescence donor, Geuda Sapphire, was the key process of developing the new method. We will also discuss efficient FRET from the dim donor.

日時 2023年1月11日（水）　16：30〜18：00
場所 分子科学研究棟　研究棟201号室
題目 FRET imaging by detecting sensitized acceptor anisotropy with dim fluorescent donor
講演者 水野　秀昭　教授
KU Leuven
]]> 第26回CIMoSセミナー分子シミュレーションによるRNA折りたたみの研究 - セミナー・シンポジウム tag:cimos.xsrv.jp,2022:/organization/cimos/se//12.822 2022-09-08T07:30:48Z 2022-08-29T13:45:57Z RNAは遺伝情報の仲介だけでなく、様々な細胞内の調節機能に関与していることが明ら... webmaster RNAは遺伝情報の仲介だけでなく、様々な細胞内の調節機能に関与していることが明らかになってきている。それら機能メカニズムを考える上で、RNAの三次構造がどのように形成、変化するのか理解する必要がある。例えば、リボザイムは特定のコンパクトな構造に折りたたむことが触媒活性に必須であり、メッセンジャーRNAや長鎖ノンコーディングRNAなども特定の部分構造が翻訳調節や分子認識に寄与する。我々は粗視化分子シミュレーションを用いて、RNA分子が溶液環境に応答して折りたたむ物理化学的機構を研究してきた。RNAの折りたたみは主に塩基対や塩基スタックの形成により駆動されるが、分子全体が負に帯電していることからMgなど二価イオンの影響も大きい。本セミナーでは、我々が開発してきた分子シミュレーションモデルを紹介するとともに、特にイオンとの相互作用に着目してRNAのフォールディングとミスフォールディングを調べた結果について議論する。

References

Roca, Hori, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2018) 10.1073/pnas.1717582115
Hori, Denesyuk, Thirumalai, Biophys. J. (2019) 10.1016/j.bpj.2019.04.037
Nguyen, Hori, Thirumalai, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2019) 10.1073/pnas.1911632116
Hori, Denesyuk, Thirumalai, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2021) 10.1073/pnas.2020837118
Nguyen, Hori, Thirumalai, Nat. Chem. (2022) 10.1038/s41557-022-00934-z

日時 2022年9月8日（木）　16：30〜17：30
場所 分子科学研究棟　研究棟201号室+Zoom（ハイブリッド）
題目 分子シミュレーションによるRNA折りたたみの研究
講演者 堀 直人
ノッティンガム大学薬学部
参加登録 参加を希望される方は、下記の必要事項をご記入ください。
【申込先URL】
https://registration.ims.ac.jp/CIMoS/
「秘密保持の同意」にご承諾いただき、所内外問わず登録された方のみに
　ZoomのIDとPWを配布いたします。
]]> 第25回CIMoSセミナーUnderstanding long-distance communications between kinesins through microtubule collective modes - セミナー・シンポジウム tag:cimos.xsrv.jp,2022:/organization/cimos/se//12.821 2022-09-08T06:30:20Z 2022-08-29T13:45:49Z Relationships between kinesin-1 and its ... webmaster Relationships between kinesin-1 and its walking track, microtubule, have been extensively investigated using experiments and theories. Despite decades of studying, people in the field are still puzzled about the underlined mechanism of multiple observations suggesting kinesins can communicate through the track: (1) As the neck linker docking process alone is not enough to bring the tethered head towards the next binding site, how communicating through microtubule assists this hand-over-hand walking mechanism? (2) Why at non saturated concentration, kinesin motors cooperatively bind to a subgroup of microtubules, avoiding other microtubules in the same field of view? (3) Why a new coming kinesin prefers to land towards the plus end of a previously bound kinesin? (4) What drives microtubule curvature-sensitive kinesin bind? In this talk, I will provide a unified answer to these observations.

References

Vu HT, Zhang Z, Tehver R, Thirumalai D, Sci. Adv. (2022) 8: eabn0856.
https://doi.org/10.1126/sciadv.abn0856

日時 2022年9月8日（木）　15：30〜16：30
場所 分子科学研究棟　研究棟201号室+Zoom（ハイブリッド）
題目 Understanding long-distance communications between kinesins through microtubule collective modes
講演者 Dr. Huong T. Vu
University of Warwick
参加登録 参加を希望される方は、下記の必要事項をご記入ください。
【申込先URL】
https://registration.ims.ac.jp/CIMoS/
「秘密保持の同意」にご承諾いただき、所内外問わず登録された方のみに
　ZoomのIDとPWを配布いたします。
]]> Regulation Mechanisms of the Dual ATPase in KaiC - 研究 tag:cimos.xsrv.jp,2022:/organization/cimos/re//9.819 2022-06-17T12:13:21Z 2022-06-20T08:17:35Z Proceedings of the National Academy of S... webmaster Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119, e2119627119; doi: 10.1073/pnas.2119627119 (2022)

]]> 【プレスリリース】時を刻むタンパク質の巧みなアクセル・ブレーキ操作ー概日リズムを原子から細胞スケールまで伝える省エネ分子、KaiC

]]> Elucidation of Master Allostery Essential for Circadian Clock Oscillation in Cyanobacteria - 研究 tag:cimos.xsrv.jp,2022:/organization/cimos/re//9.817 2022-06-17T12:10:41Z 2022-06-17T12:12:06Z Science Advances 8, eabm8990; doi: 10.11... webmaster Science Advances 8, eabm8990; doi: 10.1126/sciadv.abm8990 (2022)

]]> 【プレスリリース】概日リズムを奏でる時計タンパク質の内部で「２つの歯車」が噛み合う仕組み

]]> Cross-scale Analysis of Temperature Compensation in the Cyanobacterial Circadian Clock System - 研究 tag:cimos.xsrv.jp,2022:/organization/cimos/re//9.815 2022-05-20T12:03:10Z 2022-06-17T12:09:55Z Communications Physics 5, 75; doi: 10.10... webmaster Communications Physics 5, 75; doi: 10.1038/s42005-022-00852-z (2022)

]]> 【プレスリリース】どうして生物の２４時間リズムは安定なのか？ー水素原子の運動から迫る時計タンパク質の温度補償制御ー

生物の24時間リズム一定に保たれる理由　分子研、QSTなど解明
科学新聞, １０面, 2022年5月20日, 掲載

]]> 秋山グループの研究成果がPNASに掲載されました - ニュース・刊行物 tag:cimos.xsrv.jp,2022:/organization/cimos/in//10.802 2022-05-06T07:01:37Z 2022-05-25T07:02:44Z 時を刻むタンパク質の巧みなアクセル・ブレーキ操作ー概日リズムを原子から細胞スケー... webmaster 時を刻むタンパク質の巧みなアクセル・ブレーキ操作ー概日リズムを原子から細胞スケールまで伝える省エネ分子、KaiC（秋山グループら）

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]]> 秋山グループの研究成果がScience Advances に掲載されました - ニュース・刊行物 tag:cimos.xsrv.jp,2022:/organization/cimos/in//10.800 2022-04-18T06:58:37Z 2022-05-25T07:00:16Z 概日リズムを奏でる時計タンパク質の内部で「２つの歯車」が噛み合う仕組み（秋山グル... webmaster 概日リズムを奏でる時計タンパク質の内部で「２つの歯車」が噛み合う仕組み（秋山グループら）

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]]> 秋山グループの研究成果がCommunications Physicsに掲載されました - ニュース・刊行物 tag:cimos.xsrv.jp,2022:/organization/cimos/in//10.798 2022-04-13T06:53:03Z 2022-05-25T06:55:25Z どうして生物の２４時間リズムは安定なのか？ー水素原子の運動から迫る時計タンパク質... webmaster どうして生物の２４時間リズムは安定なのか？ー水素原子の運動から迫る時計タンパク質の温度補償制御ー（秋山グループら）

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]]> Slow and Temperature-compensated Autonomous Disassembly of KaiB-KaiC Complex - 研究 tag:cimos.xsrv.jp,2022:/organization/cimos/re//9.812 2022-02-01T12:01:23Z 2022-06-17T12:02:34Z Biophysics and Physicobiology 19, e19000... webmaster Biophysics and Physicobiology 19, e190008; doi: 10.2142/biophysico.bppb-v19.0008 (2022)

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